Inter Island Cup yang digelar pada tahun 2012 ini menjadi pengalaman kedua Arema, sejak didirikan pada 11 Agustus 1987. Perjalanan Arema di Inter Island Cup 2012 berakhir di babak semifinal, lebih baik dari ajang sebelumnya.
Pada turnamen pramusim ini, Arema ditunjuk sebagai tuan rumah Grup C, di mana Stadion Kanjuruhan, Kabupaten Malang menjadi venue-nya. Selain Arema, di grup ini ada klub-klub seperti Persipura Jayapura, Persiwa Wamena, dan Persela Lamongan.
Arema lolos ke babak semifinal setelah menjadi juara Grup C dengan tujuh poin, hasil dua kali menang dan sekali seri. Saat itu, jumlah poin yang dikumpulkan, selisih gol, dan head to head Arema dan Persipura sama semua.
Untuk menentukan juara grup sekaligus yang berhak lolos ke babak selanjutnya, diadakanlah lempar koin undian oleh wasit. Arema akhirnya lolos bersua Sriwijaya FC di babak semifinal, meski akhirnya terhempas.
Pertandingan Arema di Inter Island Cup 2012
Babak Penyisihan Grup C, Stadion Kanjuruhan), Kabupaten Malang
8 Desember 2012
Arema 3-0 Persela (Beto Goncalves 27. 47, Qischil Gandrum 48)
10 Desember 2012
Arema 1-1 Persipura (Beto Goncalves 59 – Ferinando Pahabol 29)
12 Desember 2012
Persiwa 0-1 Arema (Sunarto 71)
Klasemen Grup C
1. Arema 3 2 1 0 5-1 7
2. Persipura Jayapura 3 2 1 0 5-1 7
3. Persela Lamongan 3 0 1 2 0-4 1
4. Persiwa Wamena 3 0 1 2 0-4 1
Babak Semifinal
16 Desember 2012, Stadion Manahan, Solo
Sriwijaya FC 1-0 Arema (Ponaryo Astaman 69 PK)
NB: Arema gagal lolos ke babak final
Juara Inter Island Cup 2012
Sriwijaya FC
Top Skorer
Lancine Kone (Persisam Samarinda) 4 gol
Pemain Terbaik
Muhammad Roby (Persisam Samarinda)